Lečenje je isključivo hirurško. Operacija je nekada veoma jednostavna i efikasna a nekada jako komplikovana sa neizvesnim uspehom. Svrha operacije je da se fistula izvadi. Kod komplikovanih fistula postoji opasnost da se i pored stručno izvršene operacije fistula ponovo javi (recidiv) ili da dođe do inkontinencije (nemogućnost zadržavanja stolice i vetrova).
Da bi operacija bila efikasna važno je da se ispoštuju određeni principi. Sfinkter može da se seče samo jednom i to vertikalno na njegova vlakna. Tamponada, ako je rađena, ostaje samo 24 časa i nesme da se ponavlja. Unutrašnji otvor fistuloznog kanala obavezno mora da se nađe. Kod potkovičastih fistula moraju da se nađu svi dodatni kanalići.Kod osoba koje boluju od Kronove bolesti lečenje fistule je komplikovanije. Pre i posle operacoje koriste se imunosupresivni lekovi, kortikosteroidi, antibiotici .Komplikacije fistule
Ovo je hronična bolest koja ne može sama od sebe da prođe. Postoji mogućnost nastanka karcinoma na bazi fistule. Zato je neophodno hirurško lečenje pre no što eventualno dođe do te komplikacije.

ja sam imala istu dijagnazu ,i imala uzasne bolove ,po preporuci dr galeba sam se operisala,ali sam sada super ,pod hitno ih ukloni nije dobro da cekas ,zato samo napred biće ti mnogo bolje sretno